Un baron face aux princes
Jean pèse sur toute la politique comtoise. En 1289-1290, allié à Rodolphe de Habsbourg, il assiège Besançon, affaiblissant son neveu le comte Othon IV ; la ville achète la paix pour 8 000 livres. En 1293, il acquiert la vicomté de Besançon, contestée par l'archevêque mais confirmée par Adolphe de Nassau. Lorsque Othon IV cède le comté à Philippe le Bel, il anime avec Jean de Chalon-Auxerre la ligue des barons comtois (1294-1301), avant de trouver un accommodement : MedLands signale une charte royale du 28 août 1306 le reconnaissant gouverneur de Bourgogne. En 1305, il mène aussi une guerre contre son neveu Renaud de Bourgogne, comte de Montbéliard, pour faire reconnaître sa suzeraineté sur Dramelay.
Montmirey, un château face à la menace d'Arlay
En 1306, Eudes de Souvent, seigneur de Saint-Loup, vend le château de Montmirey et ses dépendances à Mahaut d'Artois. Selon les notes de Jean Bourge, fondées sur les recherches de l'historien Jacky Theurot, et selon l'office de tourisme Jura Nord, la rivalité avec Jean de Chalon-Arlay pousse la comtesse à faire de lourds travaux de fortification, qui agrandissent le château en quatre ans, jusqu'en 1310 ; une quasi-reconstruction serait documentée dès 1307. Le site contrôlait la route de Pesmes à Dole et touchait aux terres du duc de Bourgogne et aux confins du diocèse de Langres. Jean n'est donc pas le bâtisseur de Montmirey mais l'adversaire dont la menace en dicta le renforcement. Les sources consultées parlent de fortification et d'agrandissement, non de restauration.
Un réseau de places et de fondations
Au-delà d'Arlay et de Nozeroy, à laquelle il accorde une charte de franchises, l'Inventaire du patrimoine de Bourgogne-Franche-Comté attribue à « Jean de Chalon Arlay 1er » la construction du château de Rochejean (Doubs) en 1266-1267, place détruite en 1639. Ses relations avec les établissements monastiques du Jura sont attestées par un accord de 1304 avec la chartreuse de Bonlieu sur La Chaux-du-Dombief, connu par une copie de 1629 conservée à Besançon. Mort en 1315, il est inhumé à l'abbaye cistercienne de Mont-Sainte-Marie, nécropole de la famille.
Fortification du château de Montmirey par Mahaut d'Artois
1306-1310 · Travaux menés face à la rivalité de Jean de Chalon-Arlay, après l'achat de 1306.
Montmirey-le-Château (Jura)Siège de Besançon
1289-1290 · Jean de Chalon-Arlay, allié à Rodolphe de Habsbourg, assiège la ville, qui traite pour 8 000 livres.
Besançon